Mười năm đã trôi qua kể từ khi kết thúc Bakumatsu, một kỷ nguyên chiến tranh chứng kiến cuộc nổi dậy của công dân chống lại Mạc phủ Tokugawa. Các nhà cách mạng muốn tạo ra một thời kỳ hòa bình, và một đất nước thịnh vượng không bị áp bức. Thời đại mới của Minh Trị đã đến, nhưng hòa bình vẫn chưa đạt được. Kiếm bị cấm nhưng mọi người vẫn bị sát hại trên đường phố. Trẻ mồ côi của các cựu chiến binh không còn nơi nào để đi, trong khi chính phủ dường như chỉ bằng lòng lót túi của họ bằng tiền.

Một samurai lang thang, Kenshin Himura, vẫn làm việc để đảm bảo các giá trị mà anh ta chiến đấu xứng đáng với cuộc sống đã bỏ ra để mang lại kỷ nguyên mới. Từng được biết đến với cái tên Hitokiri Battousai, ông được coi là kẻ giết người tàn nhẫn nhất trong tất cả các nhà cách mạng. Bây giờ bị ám ảnh bởi cảm giác tội lỗi, Kenshin đã thề sẽ không bao giờ giết người một lần nữa để chuộc tội cho cuộc sống mà anh ta đã lấy, và anh ta có thể không bao giờ biết đến hòa bình cho đến khi giết người là quá khứ.

Bây giờ vào năm Minh Trị thứ 11, Kenshin tình cờ gặp Kaoru Kamiya, chủ sở hữu và người hướng dẫn chính của một võ đường nhỏ đang bị đe dọa đóng cửa. Lực lượng cảnh sát bất lực trong việc ngăn chặn chuỗi vụ giết người được thực hiện nhân danh võ đường của cô bởi một người đàn ông tự xưng là Battousai nổi tiếng. Cuộc lang thang của Kenshin tạm dừng lại khi cậu tham gia cùng Kaoru để xóa tên của cả hai. Nhưng anh ta có thể ở lại bao lâu trước khi quá khứ bắt kịp anh ta?